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糖尿病相关缺血性卒中患者的 miRNA 调控网络和潜和潜在生物标志物的鉴定

 

Authors Zhou H, Huang L, Liang L, Chen L, Zou C, Li Z, Li R, Jian C, Zou D

Received 12 May 2021

Accepted for publication 29 June 2021

Published 7 July 2021 Volume 2021:14 Pages 3213—3223

DOI https://doi.org/10.2147/IJGM.S319503

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Editor who approved publication: Dr Scott Fraser

目的:型糖尿病增加缺血性脑卒中的风险并导致其预后不良。本研究旨在探讨 型糖尿病相关缺血性脑卒中的分子失调机制及鉴定可能作为生物标记的候选基因。
方法:本研究从基因表达综合数据库Gene Expression Omnibus, GEO中的 GSE21321 和 GSE22255S 两个数据集分别收集 型糖尿病和缺血性脑卒中的基因表达谱数据,利用差异表达分析分别获得 型糖尿病与对照组以及脑梗死与对照之间的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),取前面 25% 变异基因用于共表达分析。本研究还分析了它们之间的共表达基因的交集基因和差异表达基因的交集基因的公共部分。另外,本研究还分析了 型糖尿病相关缺血性脑卒中中差异表达的 miRNAs。最后,本研究使用 CIBERSORT 来评估 型糖尿病相关脑卒中免疫细胞浸润程度。
结果:本研究在 型糖尿病组中鉴定出了 13 个共表达模块,在缺血性脑卒中组中鉴定出了 10 个共表达模块,在 型糖尿病和缺血性脑卒中两种条件下发现了 594 个模块基因。另外,本研究共发现 4452 个在 型糖尿病和对照组之间有差异表达的 mRNAs,发现了 2390 个在缺血性脑卒中和对照组之间差异表达的 mRNAs。有 771 个共集基因富集在免疫相关生物学功能和信号通路中,其中 UBE2NTGFB3EXOSC1 和 VIM 被鉴定为潜在的生物标记物。另外,我们发现 miR-576-3p 在 型糖尿病和缺血性脑卒中中都起到了重要的调节作用,活化的肥大细胞在 型糖尿病中显著下调,而它在缺血性脑卒中中却表现为上调。
结论:本研究的相关发现提供了 型糖尿病相关缺血性脑卒中潜在的靶点和信号通路,这些发现有助于确定 型糖尿病相关缺血性脑卒中的治疗靶点。
关键词型糖尿病;缺血性脑卒中;miRNAs;候选基因;免疫应答